由于有关饶漱石的一些重要档案资料至今未完全解密。这是导致华东解放军、华东野战军统属及领导关系扑朔迷离、众说纷纭的原因之一。
毛泽东1948年淮海战役前夜致电华东局书记饶漱石，严词批评华东局及粟裕：
漱石同志：
自中央子虞电至今已九个月，未寒电至今已两个半月，华野前委书记（按：粟裕）对于执行中央请示制度及在军队中开展反对无纪律无政府状态反对事前不请示事后不报告经验主义与游击主义的恶劣作风，至今没有表示态度，亦未申明理由，在此问题上失去主动性，落在一切兵团之后，实属不合。
你是华东军区及华野全军的政治委员，现责成你传达中央意旨，处理此问题，并以结果告为盼。军委三十亥 （1948.10.30）
电文中明确提到：饶漱石是是华东军区及华野全军的政治委员。
此外，历史还留下了一些实物证据。以下是华东野战军的内部流通劵和布告（1948年3月）：
【历史文物说明】
上图为1948年3月，华东军区使用的军用流通券，面额共有五十元、一百元与五百元三种。
流通券的背面印有“中国人民解放军华东野战军司令部布告”：
本军奉命解放华东，军行所至，军民交易，一律使用本军军用流通券。
兹规定：
一、流通券面额每拾元值稻米一市斤；
二、本军将来决照券面规定官价全部收回此券；本军在可能时，当随地兑换此券。仰军民人等一体遵照毋违。
此布
司令员陈毅
副司令员粟裕
政治委员饶漱石
民国三十七年三月
这批流通券的式样是由董必武任办事处主任的华北财经办事处规定，并由中共晋冀鲁豫分局（即邯郸局）所属的冀南银行（中国人民银行的前身）制版发行的。原件现存中国金融博物馆。
【饶漱石在华东】
1946年春，饶漱石和周恩来、叶剑英、罗瑞卿同为北平军调部的中共代表，饶任书记，主持军调部工作。并以中共代表的身份，在伍修权等人的陪同下，和美国代表白鲁德、国民党代表赵家骧等飞往沈阳，参与国共东北停战协调。
当时，我军还没有实行军衔制，为便于同国民党军方代表进行平等工作，我军派往各地代表被临时授予军衔，沈阳代表饶漱石为中将。而太原代表陈赓（1955年授大将）、本溪代表许光达（1955年授大将）、北平代表宋时轮（1955年授上将）、四平代表耿飙（1955年授上将）、徐州代表韦国清（1955年授上将）等人仅被授予少将军衔。由此可见，饶漱石当时在我党我军地位非常之高。饶漱石也是新中国成立前被我党授予军衔最高的将领之一。当时授予中将的只有周恩来、叶剑英、罗瑞卿等人。
饶漱石舌战美蒋代表，坚决捍卫了我党我军利益。在他的调停下，三方签订了短暂的15天停火协议，为林彪指挥东北民主联军战略转移赢得了宝贵的时间。随后，饶悄悄返回延安，向党中央汇报情况后便返回山东，领导华东军民进行土地改革、整军备战。
1946年10月，饶漱石任中共中央副秘书长兼组织部部长，仍兼任中共华东局书记、华东军区政委。
解放战争初期，由于饶不在华东，华东局和新四军兼山东军区的工作暂由陈毅主持，但陈毅难以有效地统一领导华中、山东两部，甚至发展到山东、华中两部的主要领导相互指责。
1946年9月23日，中共中央同意陈毅21日建议：山东、华中两野战军集中行动，两个指挥部也合一，合一后陈毅为司令员兼政委，粟裕任副司令员，谭震林任副政委。但两野战军意见不能统一，两方面的领导人包括陈毅在内纷纷给中央发电报，盼饶漱石回华东主持大局。
1946年12月，时任中共中央副秘书长、中央组织部部长、华东局书记、新四军政委兼山东军区政委的饶漱石从延安赶到临沂，撤销了华中分局，把邓子恢、张鼎丞、曾山三名中央委员调到华东局当常委（邓任副书记、张任组织部长）；组建了华东我军统一的指挥机关——华东人民解放军总部（后改为华东军区）。将华中、山东野战军兵合一处，正式组建成华东野战军，彻底结束了山野、华野互不买帐的混乱局面。
陈毅任华东军区兼华东野战军司令员，饶漱石兼任华东军区政委（华东野战军行政上隶属华东军区领导）。分工为饶漱石、张云逸指挥华东军区的部队（30万人），陈毅、粟裕指挥华东野战军（约27万人）。
1947年10月，中央军委又将华东野战军东兵团（又称内线兵团）4个纵队划归饶漱石直接指挥。
1948年5月陈毅调中原局任副书记兼中原军区、中原野战军副司令员后，华野在军事上的排名为饶漱石、粟裕。
此时，饶漱石是华东战区的最高统帅。从1947年2月到1947 年7月，饶漱石作为华东战区的最高统帅，领导和参与指挥了莱芜战役、孟良崮战役、白塔埠战役、蒙泰战役、南麻临朐战役等。
饶漱石作为华东战区党政军最高负责人，不但 统筹后勤工作，也参与前线指挥工作，军事工作根据中央军委制订的总军事方针和战略部署，督导华东各部队切实执行中央军委的统一战略意图。
饶漱石担任华东战区军事负责人期间，直接指挥了山东的胶东保卫战、胶河战役、周张战役、潍县战役、兖州战役，是山东解放的最大功臣，受到毛泽东的表扬（见杨尚昆《回忆高饶事件》）。饶漱石还指挥了苏北的李堡拼茶战役、盐南战役、益林战役。
1948年7月，饶漱石策划攻占济南。饶漱石召集华野东、西兵团的指挥人员，举行了第一次曲阜会议。
饶漱石 由于参加中央9月会议，派华东军区政治部主任舒同带来济南的军事情报，并委托粟裕主持华野东、西兵团会商攻济打援（华东的济南战役攻城和中原的济徐战役打 援），1948年9月15日饶漱石回到华东局，指挥了华东的许世友的攻城作战（许世友的作战部署是饶漱石批准的）。
1948年10月，饶漱石召集了华野东、西兵团的指挥人员，举行第二次曲阜会议，饶漱石主持会议并制定了淮海战役的作战部署。淮海战役开始后，饶漱石作为华东战区最高指挥官，全面负责华东方面的指挥工作（包括军事情报、军事部署、兵源补充、俘虏处理、前线支 援等），和中原前线总前委一起指挥了淮海战役。
京沪杭战役（包括渡江战役、上海战役），饶漱石作为第三野战军政委和邓小平一起指挥了渡江战役（渡江战役是华东局、淮海战役总前委、华东军区一起指挥的）。
中华人民共和国建立后，饶漱石任中共华东局第一书记，中央人民政府委员，华东军政委员会主席。
1952年饶漱石奉调北京，任中共中央组织部部长。1954年被作为“高饶反党集团”(高岗、饶漱石)主犯，受到批判。1955年3月被开除出党。
1965年8月，因潘汉年案件，最高人民法院判处饶漱石有期徒刑14年，剥夺政治权利10年。1965年9月23日，被假释出狱。
文化大革命爆发后，1967年饶漱石被重新收监。 1975年3月2日病死于秦城监狱，享年72岁。
饶漱石倒台后，华东军史被后人不断篡改。
华东人民解放军总部的历史存在被无视。由华东人民解放军总部兼充的华东军区，则被用来取代华东人民解放军总部，并将其贬为地方性质；实际上是将华东人民解放军最高指挥机关即华东人民解放军总部的功能抹杀掉。
由于当时华东人民解放军总部主要是由饶漱石、张云逸等主持，抹掉华东人民解放军总部那么华东指挥功劳就全归华野军事指挥员，再将饶潄石在华野长期担任的政委职务抹掉，再抹掉山东战区的谭许王，则华东以及淮海战役战功就似乎全归在粟裕名下了。于是出现了一个特别高大的华东战神。
可惜，这种新造神运动并不是真实的历史。
杨尚昆谈饶漱石：在华东有功
饶漱石，……他有较强的工作能力，曾被少奇同志誉为“优秀的青年革命家”。1947年国民党军队重点进攻山东解放区期间，他在谭震林、黎玉、许世友等同志协助下，领导军民就地坚持斗争，渡过难关，曾受到毛主席表扬。但是，这个人城府很深，寡言笑，少交往，几乎没有朋友，也极少主动找干部谈心。平时他给人的印象是原则性强、作风严谨、处事平稳;生活作风上同高岗相反，烟、酒不沾，从不跳舞、宴客，道貌岸然。可是，同他共事较久的同志对他的评价都不好：原中共中央东南分局秘书长李一氓说饶“心胸狭窄，权欲很重”;原中共中央华东局秘书长魏文伯说饶“一讲权威，二讲权术”;曾做过他的政治秘书的艾丁说饶是“伪君子”。
饶的权位观念重，我也领教过一次：1946年底前后，北平军事调解处执行部解散，饶(军调期间任中共代表团顾问)飞回延安。我去机场接他，招呼他“小饶”，他就像没有听见一样;我追上前喊一声“饶政委”，他才答应。过后我向陈毅提起这件事。陈说，饶这人就是这样。
